Actualités

Période
Blé
article

06 juin 2023

Rédaction : H. Bergès, A. Bellec et M. Aizpuru

Production de la première séquence de référence du chromosome 3B, chromosome de blé tendre

Le blé tendre (<em>Triticum aestivum L.</em>) représente la première céréale cultivée au monde en termes de surfaces et constitue l’aliment de base de plus d’un tiers de la population mondiale. Fruit d’un travail de sélection continu conduit par l’homme depuis des millénaires, les variétés actuelles de blé tendre possèdent un génome complexe, dit polyploïde, associant trois sous-génomes, et dont la taille représente cinq fois celle du génome humain. Si cette complexité en fait un bon modèle pour l’analyse des grands génomes polyploïdes, le décryptage de sa séquence a représenté un véritable défi technique et méthodologique, qui a longtemps retardé le développement des programmes de génomique et de séquençage en particulier.
Barbeau <i>Barbus barbus</i>
article

06 juin 2023

Rédaction : M. Aizpuru

L’histoire évolutive et les traits des espèces déterminent leur vulnérabilité aux changements climatiques

Des chercheurs du laboratoire Évolution et Diversité Biologique (CNRS / Université Toulouse III Paul Sabatier / ENFA) apportent un éclairage nouveau sur l’implication des caractéristiques biologiques et de l’histoire évolutive des espèces dans leurs réponses aux changements climatiques récents.
Planche d'herbier
article

06 juin 2023

Rédaction : M. Aizpuru

La génomique revitalise les collections des muséums

Les muséums d’histoire naturelle jouent un grand rôle dans l’inventaire de la biodiversité et ont accumulé des millions de spécimens depuis les premiers travaux de Linné, il y a environ 300 ans. Aujourd’hui ces collections sont souvent sous-estimées et pourtant elles offrent l’accès à des espèces très rares voire même éteintes. Mais que peut-on faire avec de tels échantillons morts et récoltés il y a des dizaines ou des centaines d’années, si ce n’est de la systématique basée sur des caractères morphologiques ? Des chercheurs du laboratoire Evolution et Diversité Biologique ont simplement testé une technologie de séquençage à haut débit sur une espèce de graminée malgache collectée il y a 100 ans et aujourd’hui considérée éteinte. L’objectif était de comparer une partie de son génome à sa lignée sœur qui a acquis la photosynthèse C4, un caractère adaptatif à des milieux tropicaux ouverts (savanes). Leur étude démontre qu’il est désormais possible de reconstituer le génome d’espèces éteintes ouvrant des perspectives dans de nombreux champs de recherche.
injection
article

06 juin 2023

Rédaction : Gael Esteve

Agriculture : Comprendre les mécanismes d’émergence de nouvelles maladies

Comprendre comment les agents pathogènes évoluent et s’adaptent pour devenir plus agressifs ou capables d’infecter de nouveaux hôtes constitue un enjeu majeur en santé publique comme en agriculture. Afin de mieux comprendre les mécanismes de cette adaptation, des chercheurs du Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes (LIPM - INRA / UT3) et Évolution et Diversité Biologique (EDB - CNRS / UT3) ont justement recréés, en laboratoire, les conditions d’évolution d’une bactérie pathogène de plante. Cette étude a permis d’identifier plusieurs mutations au niveau de gènes clefs de voûte de l’adaptation à la plante hôte.
Forêt tropicale
article

06 juin 2023

Rédaction : GE

Stocks de carbone des forêts tropicales : Evaluer pour mieux protéger

Les forêts tropicales, sont d’importants réservoirs de biodiversité et jouent également un rôle essentiel dans le cycle du carbone. Leur dégradation pourrait donc avoir de graves conséquences sur le climat de notre planète. Une étude menée par de nombreux chercheurs de par le monde et coordonnée par Jérôme Chave (EDB) propose des outils statistiques pour évaluer de manière plus précise les conséquences de la déforestation tropicale sur le cycle du carbone.
Larves et puceron
article

06 juin 2023

Rédaction : Marie Aizpuru

Vers une compréhension fonctionnelle des effets de la température et de l'enrichissement sur les interactions entre espèces, sur l'omnivorie et sur la structure du réseau trophique

Révéler les liens entre les traits fonctionnels des espèces, la force des interactions et la structure du réseau trophique est d'une importance primordiale pour comprendre et prévoir les relations entre la diversité et la stabilité du réseau trophique dans un monde en évolution rapide. Cependant, les effets interactifs des perturbations environnementales sur chaque espèce, les interactions trophiques et le fonctionnement des écosystèmes sont mal connus. Dans cette étude, nous avons combiné modélisation et expériences en laboratoire pour étudier les effets du réchauffement et de l'enrichissement sur un système tri-trophique terrestre. Nous avons constaté que la structure du réseau trophique est extrêmement variable et commute entre compétition par exploitation et omnivorie selon les effets de la température et de l'enrichissement des comportements alimentaire et de prédation des espèces. Notre modèle contribue à identifier les mécanismes expliquant le rôle des effets environnementaux en cascade à travers la chaîne alimentaire et comment la topologie des réseaux trophiques est influencée. Nous concluons qu'il est essentiel de considérer les facteurs environnementaux et la structure flexible du réseau trophique afin d'améliorer notre capacité à prédire les effets des changements globaux sur la diversité et la stabilité des écosystèmes.
article

06 juin 2023

Rédaction : G.Esteve

Plan B pour Biodiversité ?

Madagascar demeure l’un des derniers bastions de la biodiversité. Cependant, ce « hot-spot », véritable réservoir d’espèces souvent endémiques (c’est-à-dire ne vivant que dans cet endroit) est à son tour menacé. Figures emblématiques de l’île, les lémuriens représentent également le groupe de mammifères qui, au niveau mondial, est le plus en danger d’extinction. Sans surprise, l’activité humaine est encore une fois pointée du doigt. Cependant plusieurs chercheurs et biologistes de la conservation, dont ceux du laboratoire EDB, se sont rassemblés afin de proposer un plan conciliant intérêt économique et sauvegarde du patrimoine naturel.
Coupe d’eucalyptus
article

06 juin 2023

Rédaction : MA com FR AIB

L’imagerie cellulaire : voir toujours plus

EXTRAIT - La lettre régionale de l'enseignement supérieur et de la recherche en Midi-Pyrénées - MARS 2015 - N°37
Affiche présentation TPMP
article

06 juin 2023

Rédaction : Com Inra

Toulouse Plant Microbe Phenotyping Platform (TPMP) : une nouvelle approche pour l'étude des interactions plantes-microorganismes-environnement

Dans le cadre du cycle de conférences Les Sciences pour Tous, Mehdi Khafif, ingénieur au sein du Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes (LIPM), présentera la plateforme « Toulouse Plant Microbe Phenotyping » (TPMP) dédiée au phénotypage automatisé à haut débit d’analyse et en conditions contrôlées d'espèces végétales et microbiennes, mardi 5 mai 2015 13h30, en salle de conférence Marc Ridet INRA Auzeville. Cette conférence sera suivie d'une visite de la plateforme.
article

06 juin 2023

Rédaction : JC, DR

La plateforme TPMP dans sa nouvelle configuration et premiers retours des utilisateurs, le 16 septembre 2016

Le LabEx TULIP et la FR AIB présentent la nouvelle configuration de la plateforme Toulouse Plant Microbe Phenotyping (TPMP) suite à l'extension « TPMP2 ». Un retour d'expérience de ceux ayant déjà travaillé sur la plateforme sera en outre présenté, et une discussion sera ouverte afin de pouvoir répondre à toutes questions et collecter les suggestions.
article

06 juin 2023

Rédaction : LabEx TULIP

Ecology & Evolution - Vers une approche mécanistique de la réponse adaptative aux changements globaux

La compréhension des modalités permettant aux organismes de faire face aux changements globaux est un défi scientifique majeur. Les mécanismes moléculaires qui sous-tendent les réponses adaptatives rapides à ce changement climatique restent peu comprises.
article

06 juin 2023

Rédaction : Cassiède-Berjon Guillaume

Une start-up qui donne du PEPs à la recherche de TULIP !

A l’occasion du lancement de la société MicroPEP Technologies, entretien avec deux des trois fondateurs de l’entreprise, Jean-Philippe Combier chargé de recherche CNRS au sein du LRSV, une unité du LabEx TULIP, et Thomas Laurent, diplômé ESSEC, entrepreneur « green tech », marketing des innovations et prospection industrielle.
article

06 juin 2023

Rédaction : Cassiède-Berjon Guillaume

TomGEM : l’Union Européenne finance la recherche sur la tomate

Porté par un membre de la communauté TULIP, le projet TomGEM est financé à hauteur de 5,6 M€ par la Commission Européenne. Il visera à construire de nouvelles variétés de tomates et pratiques culturales pour améliorer qualité et rendement des productions agricoles face au stress thermique.
article

06 juin 2023

Rédaction : EJ

Ecole d’été dans le cadre du COST FA1306

COST FA1306 "The quest for tolerant varieties: phenotyping at plant and cellular level"
eucalyptus
article

06 juin 2023

Rédaction : MA

New Phytologist - Décryptage du génome d’Eucalyptus grandis, le feuillu le plus planté au monde

Avec une superficie mondiale de 20 millions d’hectares de plantations industrielles, les Eucalyptus sont les feuillus les plus plantés au monde. Aujourd’hui encore essentiellement destinés à la production de pâte à papier, ces arbres à la croissance rapide représentent une importante source de biomasse renouvelable et pourraient constituer, au travers des biocarburants de deuxième génération, une réponse aux demandes croissantes en énergie. Compte tenu des enjeux économiques considérables, mais aussi des enjeux sociaux et écologiques que représentent les plantations d’Eucalyptus, il est crucial de comprendre comment ceux-ci fabriquent leur « bois », résistent à des conditions climatiques contraignantes ou à des bio-envahisseurs. C’est dans cette optique qu’un consortium international impliquant l’équipe « génomique fonctionnelle de l’Eucalyptus » au LRSV (CNRS/UPS) menée par J. Grima-Pettenati, vient de décrypter le génome d’Eucalyptus grandis, véritable « Atlas » des possibilités que réserve cette espèce.
article

06 juin 2023

Rédaction : MA

Nature - Une nouvelle voie de régulation des gènes

Les microARN sont depuis longtemps considérés comme des molécules jouant un rôle dans la régulation de l’expression des gènes. En revanche, les molécules à leur origine, les transcrits primaires, si ce n’est constituer une étape intermédiaire dans l’élaboration de ces microARN ont toujours été jugés comme dénués de toutes fonctions. En révélant le rôle de ces transcrits, une équipe du LRSV (UT3 / CNRS) à l’origine de cette découverte vient non seulement d’abattre un dogme ayant résisté plus de 20 ans mais également de révéler des applications insoupçonnées… ayant déjà fait l’objet de plusieurs brevets.
article

06 juin 2023

Rédaction : MA

Cell - Les ruses moléculaires de l’Arabette

Camouflage, vitesse, illusion d’optique… Le règne animal regorge de stratégies permettant aux prédateurs de capturer leurs proies ou, inversement, à ces dernières de leur échapper. Il est cependant moins aisé de penser que de telles stratégies ont pu être déployées à d’autres échelles… telles qu’à l’intérieur même de cellules ! C’est pourtant un mécanisme surprenant qui a été découvert par un groupe de chercheurs mené par Laurent Deslandes (LIPM – INRA / CNRS) : une bactérie pathogène court-circuite les défenses des cellules végétales en empêchant le déclenchement du « signal d’alarme ». Plus étonnant encore, les cellules végétales ont en retour développé un leurre destiné à prendre l’envahisseur à son propre piège. Récit d’une découverte aux potentialités multiples.
article

06 juin 2023

Rédaction : MA

PNAS - Liens familiaux, gages d’adaptation ?

De nombreuses espèces animales vivent en meutes, couples, colonies… Pour autant, en regard d’espèces où les individus demeureraient isolés, s’il y a bien des avantages à de telles organisations sociales telles que la capture de proies ou la défense contre les prédateurs, elles présentent également des désavantages tels que faciliter la circulation de parasites et autres agents pathogènes. Afin de comprendre l’utilité ou les conséquences génétiques de ces « structures sociales », Bárbara Parreira, étudiante de thèse à l’Instituto Gulbenkian de Ciência et L. Chikhi (EDB / Instituto Gulbenkian de Ciência / LabEx TULIP / LIA BEEG-B) ont étudié l’influence de la structure sociale sur la variabilité génétique des individus et donc, sur le potentiel d’adaptation des populations.
article

11 avril 2016

Rédaction : MA

Mur d'actualités de la Fédération

Ce panorama est un ensemble de liens vers des informations concernant la FR AIB, les unités la constituant, les plateformes technologiques, les personnels, le LabEx TULIP dont la FRAIB a été lauréate en 2011. Quelques informations issues de nos tutelles, de nos partenaires ou de sites d'intérêt complètent ce panorama.
article

06 juin 2023

Rédaction : comFRAIB

Nature Communications - Hyper dominance du cycle de carbone Amazonien

Outre leur diversité, les arbres Amazoniens occupent une place prépondérante dans le cycle du carbone. Par leur croissance et en dépit de la mortalité, ils stockent plus de carbone organique dans leur biomasse qu’aucun autre écosystème sur terre. L’extraordinaire diversité des forêts Amazoniennes dissimule cependant le fait que cette abondance d’espèces est fortement biaisée en faveur de quelques espèces « hyper-dominantes », espèces dont la fréquence est largement supérieure aux autres.
article

06 juin 2023

Rédaction : ComFRAIB

PNAS - Quand les plantes combattent les herbivores

Afin de se prémunir des attaques de leurs prédateurs, de nombreuses plantes de la famille des crucifères ont acquis une redoutable défense. Ce genre de poison, appelé « mustard oil bomb » en raison de sa prévalence chez la moutarde, n’a d’effets que lorsque la plante est consommée par un brouteur. Travaillant sur les bases génétiques de ce cocktail toxique chez la plante modèle A. thaliana, un groupe de chercheurs menés par J. Bergelson (Université de Chicago) et F. Roux (LIPM) ont réalisés une découverte surprenante. Cette défense, fruit de la sélection naturelle, n’est efficace qu’avec de très rares combinaisons de 3 gènes indépendants. En dépit de cela, plusieurs populations de plantes se dessinent pourtant en Europe de l’Ouest, signifiant un véritable « saut évolutif » pour passer directement d’une combinaison
  • 7 (current)