Protéomique

Protéomique

Protéomique

La FR AIB est étroitement associée à ProteoToul, plateforme protéomique de Toulouse, dirigée par Odile Schiltz et qui est localisée à l’Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale. La plateforme est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique du secteur public et privé. Elle appartient au réseau local des plateformes technologiques en sciences du vivant, Genotoul, et elle fait partie de l’infrastructure nationale de protéomique, ProFI. Une ingénieure, Carole Pichereaux, membre de la FR AIB, spécialisée en spectrométrie de masse assure la prise en charge des projets protéomiques de la Fédération.

Ses missions

IPT Infrastructure

Orbitrap Q-ExactivePlus (Thermo Scientific)

La plateforme propose à la communauté scientifique des stratégies en protéomique et en spectrométrie de masse structurale à la pointe du domaine. L’ensemble des prestations fournies permet de couvrir différents aspects de l’étude des protéomes :

  • L’identification et la quantification des protéines
  • L’analyse de complexes protéiques et l’identification des partenaires
  • L’étude des modifications post-traductionnelles
  • L’analyse quantitative ciblée de protéines d’intérêt
  • L’analyse de protéines entières

 

Ses outils

Plusieurs spectromètres de masse haute résolution de différentes générations, couplés à des systèmes de nano-chromatographie, constituent l’essentiel de l’équipement.

  • nanoLC-MS/MS de type Orbitrap (Thermo Scientific) pour l’analyse protéomique globale :
    • LTQ-Orbitrap Velos
    • Orbitrap Fusion
    • Q-Exactive Plus
    • Orbitrap Exploris 480
  • nanoLC-MS/MS de type Q-TOF : TimsTOF SCP (Bruker) pour l’analyse protéomique de haute sensibilité
  • Un spectromètre de masse de type Q-TOF : Synapt G2-Si (Waters), pour l’analyse structurale de protéines purifiées

 

Contact & accès

Pour toute demande d’analyse, contacter Carole Pichereaux ou PROTEOTOUL

Voir aussi

Date de modification : 03 juillet 2023 | Date de création : 10 septembre 2012 | Rédaction : ComFRAIB