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An LBD transcription factor acts downstream of ARF2 to control nodulation and root architecture

Maria Eugenia Zanetti - An LBD transcription factor acts downstream of ARF2 to control nodulation and root architecture

11 septembre 2024

11h - Auditorium Lynn Margulis - Pôle AgroBioSciences

Maria Eugenia Zanetti est professeure associée au Département de biologie moléculaire de l'Université de Buenos Aires et chercheuse principale au CONICET (Conseil National de Recherches Scientifiques et Techniques) en Argentine. Elle s'intéresse principalement à la compréhension des mécanismes moléculaires qui sous-tendent la symbiose des nodules racinaires établie entre les légumineuses et les bactéries fixatrices d'azote appelées rhizobia. Ses recherches se concentrent sur la caractérisation des réseaux de régulation des gènes transcriptionnels régis par les facteurs de transcription de la classe NF-Y et GRAS pendant la symbiose des nodules racinaires.

Abstract

Legume plants develop two types of root post-embryonic organs, lateral roots and symbiotic nodules, using shared regulatory components. The module composed by the microRNA390, the Trans-Acting SIRNA3 (TAS3) RNA and the Auxin Response Factors (ARF)2, ARF3, and ARF4 (miR390/TAS3/ARFs) mediates the control of both lateral roots and symbiotic nodules in legumes. Using a transcriptomic approach we have identified a member of the Lateral Organ Boundaries Domain (LBD) family of transcription factors in Medicago truncatula, designated MtLBD17/29a, which is regulated by the miR390/TAS3/ARFs module. ChIP-PCR experiments evidenced that MtARF2 binds to an Auxin Response Element present in the MtLBD17/29a promoter. MtLBD17/29a is expressed in root meristems, lateral root primordia, and noninfected cells of symbiotic nodules. Knockdown of MtLBD17/29a reduced the length of primary and lateral roots and enhanced lateral root formation, whereas overexpression of MtLBD17/29a produced the opposite phenotype. Interestingly, both knockdown and overexpression of MtLBD17/29a reduced nodule number and infection events and impaired the induction of the symbiotic genes Nodulation Signaling Pathway (NSP) 1 and 2. Our results demonstrate that MtLBD17/29a is regulated by the miR390/TAS3/ARFs module and a direct target of MtARF2, revealing a new lateral root regulatory hub recruited by legumes to act in the root nodule symbiotic program.

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© Flavio Blanco

Les 9, 10 et 11 septembre prochain la FRAIB reçoit 2 chercheurs argentins : Maria Eugenia Zanetti et Flavio Blanco dans le cadre de l'IRP franco-argentine « LOCOSYM ». Maria Eugenia Zanetti a obtenu son doctorat à l'université nationale de Mar del Plata (Argentine) en 2002. Elle a ensuite rejoint le laboratoire de Julia Bailey-Serres à l'université de Californie Riverside, en tant que chercheuse postdoctorale, où elle a mené des recherches fondamentales sur la purification par affinité des « translatomes » à partir de types de cellules spécifiques chez les plantes.

Contact: contact@fraib.fr