R.Pineau - The genomic response to drought across spatiotemporal scales in Amaranthus tuberculatus

Abstract

How genetic diversity responds to environmental change across spatiotemporal scales remains poorly understood despite its importance for species persistence in changing landscapes. Agricultural weeds offer ideal models for studying these adaptive dynamics as they rapidly evolve under both the intensive management practices designed to eliminate them and increasingly severe climate challenges such as drought.

Here, we combine experimental and herbarium genomic approaches spanning within-generation to century-long timescales to understand how genome-wide variation responds to drought in Amaranthus tuberculatus, a native plant turned problematic agricultural weed.  By combining short and long-term spatiotemporal data, we demonstrate a polygenic architecture of climate adaptation that differs consistently across human-mediated habitat types, while fluctuating environments have maintained the standing genetic variation enabling rapid evolutionary responses to contemporary selective pressures.

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Au cours de sa formation, Rozenn Pineau s’est spécialisée en écologie évolutive et génomique des populations, en particulier pour les espèces végétales en lien avec l’activité humaine. Ses recherches combinent approches expérimentales modernes et analyse de collections d’herbiers historiques, remontant jusqu’à un siècle.

En analysant la variation génétique sur de longues périodes et selon différents habitats, agricoles ou semi-naturels, elle met en évidence une architecture polygénique de l’adaptation au climat. Ces travaux apportent des éclairages essentiels pour prédire la résilience des espèces végétales face au changement climatique ainsi que pour mieux comprendre les trajectoires évolutives dans les paysages modifiés.

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