Génomique

La plateforme Génome et Transcriptome apporte à la communauté scientifique des équipements de pointe et une expertise dans le domaine du séquençage nouvelle génération, du génotypage et de l’analyse du transcriptome. Elle rassemble au sein de 5 sites, tous localisés à proximité de laboratoires, les outils indispensables pour mener une recherche de haute technicité.

Elle est rattachée à GénoToul >>>

Ses missions

• Proposer un service adapté à vos projets en génomique & transcriptomique
• Conseiller, former et animer un réseau scientifique
• Procurer aux utilisateurs les outils nécessaires, les plus performants
• Répondre au mieux aux attentes des laboratoires publics et privés

Ses principaux outils

• Séquençage nouvelle génération (1 PacBio RSII, 3 MinION, 2 HiSeq3000 Illumina, 3 MiSeq Illumina, Chromium 10x, Ion S5 Thermo, Ion PGM Thermo)
• Cellule unique (C1 Fluidigm, Chromium 10x)
• Génotypage (BioMark Fluidigm)
• PCR quantitative nano volume (BioMark Fluidigm)

Les plateformes GeT-PlaGe et Bioinformatique ont renforcé leur partenariat autour du séquençage nouvelle génération.

La plateforme GeT-PlaGe est membre du programme France Génomique (appel Infrastructures nationales 2010 des investissements d’avenir), labellisée plateforme opérationnelle IBiSA et reconnue plateforme stratégique INRA (CNOC) depuis 2008. Elle est certifiée ISO9001 : 2008.