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Menu FR AIB logos Tutelles : CNRS - UT3 (Université Paul Sabatier)

FR AIB

Protéomique

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La FR AIB est étroitement associée à l’infrastructure Protéomique de Toulouse dont le site principal est localisé à l’Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale. L’Infrastructure est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique du secteur public et privé. Un ingénieur (C. Pichereaux), membre de la FR AIB, spécialisée en spectrométrie de masse assure la prise en charge des projets protéomiques de la Fédération. Cette plate-forme assure par spectrométrie de masse, l'analyse des protéines à grande échelle depuis leurs identifications jusqu'à leurs caractérisations chimiques et l'étude de leurs interactions moléculaires.

Ses missions

L’ensemble des prestations fournies permet de couvrir différents  aspects de l’étude des protéomes :

  • l’identification des protéines,
  • l’étude des modifications post-traductionnelles,
  • l’analyse de complexes protéiques et l’identification des partenaires,
  • l’analyse quantitative globale des protéomes,
  • l’analyse quantitative ciblée de protéines d’intérêt,
  • le traitement  bioinformatique des données,
protéomique

Ses outils

  • Plusieurs spectromètres de masse de dernière génération constituent l’essentiel de l’équipement du site principal.
    • nanoLC-ESI MS/MS utilisant des spectromètres de masse à haute résolution et haute vitesse d’acquisition  de type Orbitrap (Thermo Scientific) avec plusieurs modes de fragmentation possibles (CID, HCD, ETD) pour l’analyse protéomique globale,
    • spectromètre de masse de type Q-TRAP (Applied Biosystems) dédié à l’analyse protéomique  ciblée,
    • spectromètre de masse de type MALDI-TOF (Applied Biosystems),
  • L’analyse des interactions protéines-protéines  par système Biacore.