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Menu FR AIB logos Tutelles : CNRS - UT3 (Université Paul Sabatier)

FR AIB

Protéomique

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La FR AIB est étroitement associée à l’infrastructure Protéomique de Toulouse dont le site principal est localisé à l’Institut de Pharmacologie et de Biologie Structurale. L’Infrastructure est ouverte à l’ensemble de la communauté scientifique du secteur public et privé. 2 ingénieurs, membres de la FR AIB, assurent les analyses par spectrométrie de masse et le suivi des projets protéomiques de la FR. Cette plate-forme assure par spectrométrie de masse, l'analyse des protéines à grande échelle depuis leurs identifications jusqu'à leurs caractérisations chimiques et l'étude de leurs interactions moléculaires.

Ses missions

L’ensemble des prestations fournies permet de couvrir différents  aspects de l’étude des protéomes :

  • l’identification des protéines,
  • l’étude des modifications post-traductionnelles,
  • l’analyse de complexes protéiques et l’identification des partenaires,
  • l’analyse quantitative globale des protéomes,
  • l’analyse quantitative ciblée de protéines d’intérêt,
  • le traitement  bioinformatique des données,
protéomique

Ses outils

  • Plusieurs spectromètres de masse de dernière génération constituent l’essentiel de l’équipement du site principal.
    • nanoLC-ESI MS/MS utilisant des spectromètres de masse à haute résolution et haute vitesse d’acquisition  de type Orbitrap (Thermo Scientific) avec plusieurs modes de fragmentation possibles (CID, HCD, ETD) pour l’analyse protéomique globale,
    • spectromètre de masse de type Q-TRAP (Applied Biosystems) dédié à l’analyse protéomique  ciblée,
    • spectromètre de masse de type MALDI-TOF (Applied Biosystems),
  • L’analyse des interactions protéines-protéines  par système Biacore.